Всякий раз, возвращаясь из экспедиций на Печору, Николай Ончуков привозил несметные сокровища: сказки, былины, народные драмы. Опубликованные впоследствии сборники, составленные по материалам его путешествий, так и назывались - «Печорские былины» (1904), «Северные сказки» (1909), «Северные народные драмы» (1911).

В советское время Николай Евгеньевич пытался продолжать любимое дело, ездил в Чердынский, Тавдинский края и на Украину, принимал участие в работе над академическим «Словарём русского языка», но, подобно многим деятелям культуры, угодил под колёса тоталитарной машины: в 1939 году он был арестован, а затем осуждён на 10 лет.

Пожилой учёный не вынес тягот заключения, он умер задолго до окончания назначенного срока. Его посмертная реабилитация состоялась лишь в годы перестройки, в 1989 году.